Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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PTPRDP23468 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRDP23468 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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