Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
COPS7AQ9UBW8 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
COPS7AQ9UBW8 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms