Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms