Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ABLIM3-202ENST00000326685 4164 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MET-204ENST00000436117 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LHX8Q68G74 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms