Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CCDC142Q17RM4 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CCDC142Q17RM4 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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CCDC142Q17RM4 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC142Q17RM4 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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