Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LAMA3Q16787 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LAMA3Q16787 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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