Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms