Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.32
SKIV2LQ15477 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms