Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PEX6Q13608 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms