Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms