Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3AQ13472 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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