Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TCOF1Q13428 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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