Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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