Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms