Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLF12Q9Y4X4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLF12Q9Y4X4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms