Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NRXN3Q9Y4C0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms