Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FZD1Q9UP38 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FZD1Q9UP38 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms