Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DENND2AQ9ULE3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2AQ9ULE3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms