Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELP3Q9H9T3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms