Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRIP1Q9BX63 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRIP1Q9BX63 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms