Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms