Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM20AQ96MK3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM20AQ96MK3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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