Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms