Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms