Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRIPQ8WXE1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms