Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWDEQ8N2E2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms