Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOM1L2Q6ZVM7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOM1L2Q6ZVM7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms