Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms