Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CARMIL1Q5VZK9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL1Q5VZK9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms