Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARFGEF3Q5TH69 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms