Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HABP4Q5JVS0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HABP4Q5JVS0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms