Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI3KQ59H18 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms