Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HADHQ16836 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HADHQ16836 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HADHQ16836 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HADHQ16836 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HADHQ16836 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HADHQ16836 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HADHQ16836 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms