Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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