Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIV2LQ15477 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms