Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSHL1Q14406 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms