Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3B2Q13435 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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