Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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