Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMOD3Q0VAK6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMOD3Q0VAK6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms