Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LRP1Q07954 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms