Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD3P84022 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms