Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRPF1P55201 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF1P55201 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms