Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VEGFBP49765 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VEGFBP49765 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms