Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCC1P33527 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms