Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms