Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARK3P27448 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARK3P27448 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
MARK3P27448 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MARK3P27448 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MARK3P27448 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MARK3P27448 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARK3P27448 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARK3P27448 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms