Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTFRP26992 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms