Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FGFR3P22607 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms