Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1P21675 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1P21675 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1P21675 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1P21675 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1P21675 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1P21675 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1P21675 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1P21675 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1P21675 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1P21675 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1P21675 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1P21675 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1P21675 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1P21675 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1P21675 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1P21675 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1P21675 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1P21675 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1P21675 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1P21675 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1P21675 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1P21675 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1P21675 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1P21675 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1P21675 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms