Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CETPP11597 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CETPP11597 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CETPP11597 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CETPP11597 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CETPP11597 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CETPP11597 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CETPP11597 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CETPP11597 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CETPP11597 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CETPP11597 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CETPP11597 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CETPP11597 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CETPP11597 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CETPP11597 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CETPP11597 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CETPP11597 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms